一項研究綜合分析了來自世界各地559例食管癌和胃癌患者的樣本，表明了食管癌主要有兩種類型，并且它們在分子特征上有顯著性的差異，所以將食管癌列為特殊性的疾病。

此項研究來自癌癥基因組圖譜的研究網絡，并且發表在《自然》雜志上。研究包括兩個關鍵的內容：第一，位于食管上端發生的癌癥與頭頸癌相似，然而隨著食管癌的向下蔓延，所表現的癥狀與某些亞型的胃癌幾乎相同。第二，癌癥臨床試驗應根據分子亞型癥狀將患者分組，將下食管癌與胃癌分組，同時還需要單獨列出上食管癌。達加法伯癌癥研究所的食管癌研究與醫師科學家聯合領導人亞歷克斯•巴斯說：“這些研究結果為我們目前對食管癌基因組學的研究提供了深層次的理解。我們希望這項工作可以解決食管癌領域的一些長期不確定因素，并為研究人員和藥物開發者尋求更有效的臨床試驗和新的治療方法的奠定基礎。

十幾年來，醫生都知道，當把食管癌細胞放到顯微鏡下觀察，會出現兩種結構，一種是類似于胃癌或直腸癌細胞一樣的腺癌細胞的形狀，另外一種是類似肺、皮膚和頭頸部細胞的鱗狀癌細胞。目前，人們尚未了解腺食管癌和鱗狀食管癌的分化程度以及腺食管癌和胃腺癌之間的關系。

國際癌癥基因組譜圖的首席研究員兼溫安洛研究所的教授彼得•萊爾德博士說：“我們的研究表明了這種臨床亞型的癌癥在分子水平上有很大差異，食管癌的腫瘤細胞是來自食道還是胃部與人體內個體腫瘤的分子特征無關。”

這項新的報道反對研究人員將食管癌和胃腺癌進行分開，他們認為應該將食管癌和胃癌視為和直腸癌一樣的實體。該項研究表明食管癌與胃癌在分子結構上相似，而胃癌被是染色體不穩定的一類腫瘤，所以，將食管癌標志位染色體結構畸變。一些腫瘤學家也表示，這種細微的疾病觀點，即食管癌細胞的分子結構的詳細分析，可能會改變他們的研究方向和治療方法。

但是，來自斯隆•凱特琳癌癥中心的胃腸腫瘤學家耶爾納•揚吉吉安說：“從癌癥基因組譜圖的數據可以看出，食道鱗狀上皮癌和食管腺癌是完全不同的疾病，不應該被納入一個治療試驗中，在食管癌的治療過程中，合適的治療手段和治療策略的結合可以有助于食管癌的治療，這項治療都會在后續的研究中進行討論。”

雖然在美國食管癌僅占新癌癥診斷病例的1%，但是，病人在診斷的五年之類，就有五分之四的人會死去，目前的治療方法根本不能治愈這種疾病。除此之外，食管癌的病例在過去的四十年內持續上升，與七十年代中期相比，已經增加了七倍。

國際癌癥基因組譜圖研究網絡的首席研究員和系統生物學研究所的教授伊利亞•什穆列維奇博士說：“基因組圖譜的研究超越了任何一個機構或個人的工作，但是這些巨大的事業只有通過世界各地數以百計的專家和科學家的貢獻才能夠實現，他們將自己的生命獻給這些項目，希望能夠為食管癌病人找到新的治療方法，治療食管癌病人的疾病。”